报告全文如下:
基因检测号及分子病理诊断
2014- LJX-4
低分化肺鳞癌
标本类型是:□新鲜组织,□新鲜血液,□固定组织,□穿刺组织,□胸腹水,□脱落细胞
□体液,□蜡块,X石蜡白片,□石蜡白片,□涂片,□其它
基因测序结果:
1. 检测方法:NGS -高通量外显子组测序法
DNA提取和质量控制:√通过 □不通过
2. 突变检测结果:
NRAS: 第2外显子; c.3G>A|p.Met1I;杂合; 错义突变
ERBB4: 第15外显子; c.1852C>G|p.His618Asp;杂合; 错义突变
ERBB4: 第15外显子; c.1757G>A|p.Gly586Asp;杂合; 错义突变
ERBB4: 第9外显子; c.1040C>G|p.Thr347Ser;杂合; 错义突变
ERBB4: 第9外显子; c.1039A>T|p.Thr347Ser;杂合; 错义突变
ERBB4: 第9外显子; c.1033G>A|p.Ala345Thr;杂合; 错义突变
ERBB4: 第8外显子; c.889T>C|p.Phe297Leu; 杂合; 错义突变
ERBB4: 第7外显子; c.757A>G|p.Asn253Asp;杂合; 错义突变
ERBB4: 第6外显子; c.719G>A|p.Gly240Glu; 杂合; 错义突变
ERBB4: 第6外显子; c.638G>A|p.Cys213Tyr; 杂合; 错义突变
ERBB4: 第4外显子; c.544G>A|p.Gly182Ser; 杂合; 错义突变
ERBB4: 第3外显子; c.406T>A|p.Leu136Ile; 杂合; 错义突变
VHL: 第2外显子; c.431A>G|p.Tyr144Cys; 杂合; 错义突变
大连大学附属中山医院分子病理与基因检测报告单
注:结果只针对该检测样本。请结合临床!
VHL: 第3外显子; c.554A>G|p.Tyr185Cys; 杂合; 错义突变
MLH1: 第12外显子; c.1244A>T|p.Asp415Val;杂合; 错义突变
MLH1: 第13外显子; c.521A>T|p.Asp174Val; 杂合; 错义突变
MLH1: 第12外显子; c.950A>T|p.Asp317Val; 杂合; 错义突变
MLH1: 第12外显子; c.1247A>T|p.Lys416Met;杂合; 错义突变
MLH1: 第13外显子; c.524A>T|p.Lys175Met; 杂合; 错义突变
MLH1: 第12外显子; c.953A>T|p.Lys318Met; 杂合; 错义突变
CTNNB1: 第3外显子; c.142G>T|p.Gly48Cys; 杂合; 错义突变
PIK3CA: 第2外显子; c.275T>C|p.Leu92Pro; 杂合; 错义突变
PIK3CA: 第2外显子; c.304A>G|p.Ile102Val; 杂合; 错义突变
PIK3CA: 第5外显子; c.1059G>T|p.Lys353Asn;杂合; 错义突变
PIK3CA: 第8外显子; c.1310T>C|p.Val437Ala; 杂合; 错义突变
PIK3CA: 第14外显子; c.2113C>T|p.Gln705*; 杂合; 无义突变
PIK3CA: 第21外显子; c.3061T>C|p.Tyr1021His;杂合; 错义突变
PIK3CA: 第21外显子; c.3142C>T|p.His1048Tyr;杂合; 错义突变
PIK3CA: 第21外显子; c.3145G>A|p.Gly1049Ser;杂合; 错义突变
PIK3CA: 第21外显子; c.3190C>T|p.Gln1064*; 杂合; 无义突变
FGFR3: 第14外显子; c.1951A>G|p.Thr651Ala;杂合; 错义突变
FGFR3: 第14外显子; c.1957A>G|p.Thr653Ala;杂合; 错义突变
FGFR3: 第12外显子; c.1615A>G|p.Thr539Ala;杂合; 错义突变
PDGFRA: 第12外显子; c.1684A>T|p.Ile562Phe; 杂合; 错义突变
PDGFRA: 第12外显子; c.1765C>T|p.Pro589Ser;杂合; 错义突变
PDGFRA: 第14外显子; c.1975A>G|p.Asn659Asp;杂合; 错义突变
大连大学附属中山医院分子病理与基因检测报告单
注:结果只针对该检测样本。请结合临床!
PDGFRA: 第18外显子; c.2480C>T|p.Ala827Val; 杂合; 错义突变
PDGFRA: 第18外显子; c.2551T>C|p.Ser851Pro;杂合; 错义突变
KIT: 第2外显子; c.257A>G|p.Lys86Arg; 杂合; 错义突变
KIT: 第10外显子; c.1541C>T|p.Pro514Leu;杂合; 错义突变
KIT: 第10外显子; c.1553C>T|p.Pro518Leu;杂合; 错义突变
KIT: 第10外显子; c.1545C>A|p.His515Gln;杂合; 错义突变
KIT: 第10外显子; c.1557C>A|p.His519Gln;杂合; 错义突变
KIT: 第11外显子; c.1702G>A|p.Asp568Asn;杂合; 错义突变
KIT: 第11外显子; c.1714G>A|p.Asp572Asn;杂合; 错义突变
KIT: 第11外显子; c.1708A>G|p.Thr570Ala;杂合; 错义突变
KIT: 第11外显子; c.1720A>G|p.Thr574Ala;杂合; 错义突变
KIT: 第15外显子; c.2197G>T|p.Asp733Tyr;杂合; 错义突变
KIT: 第15外显子; c.2209G>T|p.Asp737Tyr;杂合; 错义突变
KIT: 第18外显子; c.2564T>C|p.Leu855Pro;杂合; 错义突变
KIT: 第18外显子; c.2576T>C|p.Leu859Pro;杂合; 错义突变
KDR: 第30外显子; c.4067T>C|p.Val1356Ala;杂合; 错义突变
KDR: 第30外显子; c.3959C>T|p.Ser1320Phe;杂合; 错义突变
KDR: 第27外显子; c.3584C>G|p.Pro1195Arg;杂合; 错义突变
KDR: 第11外显子; c.1416A>T|p.Gln472His;杂合; 错义突变
KDR: 第6外显子; c.716G>A|p.Gly239Glu; 杂合; 错义突变
FBXW7: 第9外显子; c.1261G>A|p.Val421Ile; 杂合; 错义突变
FBXW7: 第9外显子; c.1147G>A|p.Val383Ile; 杂合; 错义突变
FBXW7: 第10外显子; c.1501G>A|p.Val501Ile; 杂合; 错义突变
大连大学附属中山医院分子病理与基因检测报告单
注:结果只针对该检测样本。请结合临床!
FBXW7: 第9外显子; c.1246G>A|p.Val416Ile; 杂合; 错义突变
FBXW7: 第9外显子; c.1132G>A|p.Val378Ile; 杂合; 错义突变
FBXW7: 第10外显子; c.1486G>A|p.Val496Ile; 杂合; 错义突变
FBXW7: 第7外显子; c.922C>T|p.Gln308*; 杂合; 无义突变
FBXW7: 第7外显子; c.808C>T|p.Gln270*; 杂合; 无义突变
FBXW7: 第8外显子; c.1162C>T|p.Gln388*; 杂合; 无义突变
FBXW7: 第4外显子; c.520G>A|p.Asp174Asn;杂合; 错义突变
FBXW7: 第4外显子; c.406G>A|p.Asp136Asn;杂合; 错义突变
FBXW7: 第5外显子; c.760G>A|p.Asp254Asn;杂合; 错义突变
FBXW7: 第4外显子; c.512T>A|p.Leu171His; 杂合; 错义突变
FBXW7: 第4外显子; c.398T>A|p.Leu133His; 杂合; 错义突变
FBXW7: 第5外显子; c.752T>A|p.Leu251His; 杂合; 错义突变
APC: 第14外显子; c.3367A>G|p.Thr1123Ala;杂合; 错义突变
APC: 第16外显子; c.3421A>G|p.Thr1141Ala;杂合; 错义突变
APC: 第14外显子; c.3392A>G|p.Glu1131Gly;杂合; 错义突变
APC: 第16外显子; c.3446A>G|p.Glu1149Gly;杂合; 错义突变
APC: 第16外显子; c.3929A>G|p.Lys1310Arg;杂合; 错义突变
APC: 第16外显子; c.3934G>T|p.Gly1312*; 杂合; 无义突变
APC: 第16外显子; c.3974C>T|p.Ala1325Val;杂合; 错义突变
APC: 第16外显子; c.4019C>A|p.Ser1340Tyr;杂合; 错义突变
APC: 第16外显子; c.4075A>G|p.Lys1359Glu;杂合; 错义突变
APC: 第16外显子; c.4195C>T|p.Arg1399Cys;杂合; 错义突变
APC: 第16外显子; c.4207A>G|p.Ser1403Gly;杂合; 错义突变
大连大学附属中山医院分子病理与基因检测报告单
注:结果只针对该检测样本。请结合临床!
APC: 第16外显子; c.4541C>T|p.Pro1514Leu;杂合; 错义突变
EGFR: 第15外显子; c.1853A>G|p.His618Arg;杂合; 错义突变
EGFR: 第15外显子; c.1862A>G|p.His621Arg;杂合; 错义突变
EGFR: 第20外显子; c.2387G>A|p.Gly796Asp;杂合; 错义突变
MET: 第2外显子; c.589G>C|p.Val197Leu; 杂合; 错义突变
MET: 第2外显子; c.611C>T|p.Ser204Phe; 杂合; 错义突变
MET: 第19外显子; c.3764T>A|p.Val1255Glu;杂合; 错义突变
MET: 第19外显子; c.3710T>A|p.Val1237Glu;杂合; 错义突变
MET: 第19外显子; c.3836C>T|p.Thr1279Ile;杂合; 错义突变
MET: 第19外显子; c.3782C>T|p.Thr1261Ile;杂合; 错义突变
SMO: 第3外显子; c.616T>C|p.Trp206Arg; 杂合; 错义突变
BRAF: 第15外显子; c.1812G>A|p.Trp604*; 杂合; 无义突变
GNAQ: 第6外显子; c.818T>A|p.Leu273*; 杂合; 无义突变
GNAQ: 第5外显子; c.700G>T|p.Glu234*; 杂合; 无义突变
ABL1: 第5外显子; c.941A>T|p.His314Leu; 杂合; 错义突变
ABL1: 第5外显子; c.884A>T|p.His295Leu; 杂合; 错义突变
ABL1: 第6外显子; c.1006T>C|p.Phe336Leu;杂合; 错义突变
ABL1: 第6外显子; c.949T>C|p.Phe317Leu; 杂合; 错义突变
ABL1: 第6外显子; c.1115A>G|p.Tyr372Cys;杂合; 错义突变
ABL1: 第6外显子; c.1058A>G|p.Tyr353Cys;杂合; 错义突变
NOTCH1: 第26外显子; c.4774T>C|p.Phe1592Leu;杂合; 错义突变
RET: 第10外显子; c.1847A>G|p.Glu616Gly;杂合; 错义突变
RET: 第10外显子; c.1855T>C|p.Phe619Leu;杂合; 错义突变
大连大学附属中山医院分子病理与基因检测报告单
注:结果只针对该检测样本。请结合临床!
RET: 第10外显子; c.1862A>G|p.Glu621Gly;杂合; 错义突变
RET: 第15外显子; c.2656C>T|p.Arg886Trp;杂合; 错义突变
RET: 第15外显子; c.2702A>T|p.Glu901Val;杂合; 错义突变
RET: 第16外显子; c.2777A>G|p.His926Arg;杂合; 错义突变
RET: 第16外显子; c.2794A>G|p.Ser932Gly;杂合; 错义突变
FGFR2: 第5外显子; c.492G>T|p.Lys164Asn; 杂合; 错义突变
FGFR2: 第6外显子; c.570G>T|p.Lys190Asn; 杂合; 错义突变
FGFR2: 第7外显子; c.837G>T|p.Lys279Asn; 杂合; 错义突变
HRAS: 第3外显子; c.130G>A|p.Val44Met; 杂合; 错义突变
ATM: 第17外显子; c.2595T>A|p.Ser865Arg;杂合; 错义突变
ATM: 第26外显子; c.3932A>G|p.Gln1311Arg;杂合; 错义突变
ATM: 第34外显子; c.5140A>G|p.Met1714Val;杂合;错义突变
ATM: 第35外显子; c.5294A>T|p.Gln1765Leu;杂合; 错义突变
ATM: 第50外显子; c.7374T>A|p.Asp2458Glu;杂合; 错义突变
ATM: 第50外显子; c.7403A>T|p.Glu2468Val;杂合; 错义突变
ATM: 第50外显子; c.7414A>T|p.Asn2472Tyr;杂合; 错义突变
ATM: 第55外显子; c.8136G>T|p.Arg2712Ser;杂合; 错义突变
ATM: 第56外显子; c.8254A>G|p.Ile2752Val;杂合; 错义突变
ATM: 第63外显子; c.9077T>C|p.Leu3026Pro;杂合; 错义突变
ATM: 第63外显子; c.9118A>T|p.Ile3040Leu;杂合; 错义突变
ATM: 第63外显子; c.9136A>G|p.Ser3046Gly;杂合; 错义突变
KRAS: 第4外显子; c.376G>A|p.Asp126Asn;杂合; 错义突变
KRAS: 第4外显子; c.348T>A|p.Asn116Lys; 杂合; 错义突变
大连大学附属中山医院分子病理与基因检测报告单
注:结果只针对该检测样本。请结合临床!
KRAS: 第4外显子; c.343G>A|p.Gly115Arg; 杂合; 错义突变
PTPN11:第3外显子; c.181G>T|p.Asp61Tyr; 杂合; 错义突变
PTPN11:第3外显子; c.208A>G|p.Lys70Glu; 杂合; 错义突变
PTPN11:第3外显子; c.223G>T|p.Ala75Ser; 杂合; 错义突变
PTPN11:第3外显子; c.273G>T|p.Lys91Asn; 杂合; 错义突变
PTPN11:第13外显子; c.1558C>T|p.His520Tyr; 杂合; 错义突变
HNF1A: 第3外显子; c.685C>T|p.Arg229*; 杂合; 无义突变
FLT3: 第20外显子; c.2511G>A|p.Met837Ile;杂合; 错义突变
FLT3: 第14外显子; c.1793A>G|p.Glu598Gly;杂合; 错义突变
FLT3: 第14外显子; c.1714T>C|p.Tyr572His; 杂合; 错义突变
RB1: 第4外显子; c.430G>A|p.Val144Ile; 杂合; 错义突变
RB1: 第4外显子; c.436A>T|p.Asn146Tyr; 杂合; 错义突变
RB1: 第4外显子; c.464A>T|p.Tyr155Phe; 杂合; 错义突变
RB1: 第20外显子; c.2076T>A|p.Tyr692*; 杂合; 无义突变
RB1: 第22外显子; c.2297C>T|p.Thr766Ile; 杂合; 错义突变
AKT1: 第4外显子; c.59A>T|p.Lys20Met; 杂合; 错义突变
CDH1: 第9外显子; c.1298A>G|p.Asp433Gly;杂合; 错义突变
CDH1: 第9外显子; c.1312A>T|p.Thr438Ser;杂合; 错义突变
TP53: 第5外显子; c.442A>T|p.Arg148*; 杂合; 无义突变
TP53: 第8外显子; c.838A>T|p.Arg280*; 杂合; 无义突变
TP53: 第3外显子; c.169G>C|p.Ala57Pro; 杂合; 错义突变
TP53: 第6外显子; c.565G>C|p.Ala189Pro; 杂合; 错义突变
TP53: 第2外显子; c.131G>C|p.Cys44Ser; 杂合; 错义突变
大连大学附属中山医院分子病理与基因检测报告单
注:结果只针对该检测样本。请结合临床!
TP53: 第5外显子; c.527G>C|p.Cys176Ser; 杂合; 错义突变
TP53: 第4外显子; c.215C>G|p.Pro72Arg; 杂合; 错义突变
ERBB2: 第23外显子; c.2182A>G|p.Asn728Asp;杂合; 错义突变
ERBB2: 第19外显子; c.2272A>G|p.Asn758Asp;杂合; 错义突变
ERBB2: 第23外显子; c.2194A>T|p.Lys732*; 杂合;无义突变
ERBB2: 第19外显子; c.2284A>T|p.Lys762*; 杂合;无义突变
ERBB2: 第25外显子; c.2458A>T|p.Asn820Tyr;杂合; 错义突变
ERBB2: 第21外显子; c.2548A>T|p.Asn850Tyr;杂合; 错义突变
SMAD4:第9外显子; c.998T>A|p.Val333Asp; 杂合;错义突变
SMAD4:第10外显子; c.1163A>G|p.Gln388Arg;杂合; 错义突变
SMAD4:第12外显子; c.1532C>T|p.Pro511Leu;杂合; 错义突变
GNA11: 第4外显子; c.562G>C|p.Gly188Arg; 杂合; 错义突变
GNA11: 第4外显子; c.565A>G|p.Ile189Val; 杂合; 错义突变
GNA11: 第4外显子; c.598A>G|p.Ile200Val; 杂合; 错义突变
GNA11: 第7外显子; c.934A>G|p.Met312Val;杂合; 错义突变
JAK3: 第16外显子; c.2156T>C|p.Phe719Ser;杂合; 错义突变
JAK3: 第13外显子; c.1703C>A|p.Ser568*; 杂合; 无义突变
GNAS: 第8外显子; c.2578G>T|p.Val860Phe;杂合; 错义突变
GNAS: 第7外显子; c.604G>T|p.Val202Phe; 杂合; 错义突变
GNAS: 第8外显子; c.649G>T|p.Val217Phe; 杂合; 错义突变
GNAS: 第7外显子; c.607G>T|p.Val203Phe; 杂合; 错义突变
GNAS: 第8外显子; c.652G>T|p.Val218Phe; 杂合; 错义突变
大连大学附属中山医院分子病理与基因检测报告单
注:结果只针对该检测样本。请结合临床!
靶向及化疗药物参考:
分子靶向治疗,是在细胞分子水平上,针对已经明确的致癌位点,药物进入体内会特异性地选择致癌位点来相互结合发挥作用,使肿瘤细胞特异性死亡,而不会波及肿瘤周围的正常组织细胞。
综合该样本NRAS,ERBB4,VHL, MLH,MET, EGFR, CTNNB1,PIKCA,RET, AKT1, ALK, FGFR3 ,PDGFRB, KIT,KDR,FBXW7,APC, 及TP53突变
MET:
Crizotinib: ALK, MET, ROS1, approval for locally advanced or metastatic non-small cell lung cancer (NSCLC) that is anaplastic lymphoma kinase-positive.
EGFR:
Afatinib: EGFR, ERBB2, EGFR_L858R, EGFR_L858R/T790M, Approved for the first-line treatment of patients with metastatic non-small cell lung cancer (NSCLC) whose tumors have epidermal growth factor receptor (EGFR) exon 19 deletions or exon 21 (L858R) substitution mutations as detected by an FDA-approved test.
Erlotinib: EGFR, Approved for first-line treatment of non-small cell lung cancer; Approved for maintenance treatment of non-small cell lung cancer; Approved for non-small cell lung cancer Gefitinib: EGFR, Approved for non-small cell lung cancer; KDR:
Axitinib FLT1, KDR, FLT4, PDGFRA, PDGFRB, KIT Approved to treat advanced renal cell carcinoma after failure of prior systemic therapy.
Pazopanib: FLT1, FLT3, FLT4, KDR, KIT, PDGFRA, PDGFRB, RET, TEK, FGFR1, FGFR3, FGFR2, FGFR2_N549H Approved for advanced renal cell carcinoma
Sorafenib ABL1, ARAF, BRAF, FGFR1, KIT, PDGFRA, PDGFRB, RAF1, RET, FLT1, FLT3, KDR, FLT4, FGFR2, FGFR2_N549H
Approved for kidney cancer Sunitinib: FLT1, KDR, FLT3, FLT4, PDGFRA, PDGFRB, KIT, RET, ZNF198-FGFR1, CSF1R, FGFR1, FGFR2, FGFR2_N549H Approved for kidney cancer RET: R886W: A germline variant located in the ECD of RET that is reported in AS-MTC. The mutation has in vitro transforming potential in a GDNF-dependent manner, and it confers increased ERK1/2 activation, STAT1, and TC4 activation, downstream components of the Ret signaling cascade. Cells with this mutation are sensitive to sorafenib, a Ret and RAF inhibitor, in vitro, in a manner similar to cells with wild-type RET (Prazeres et al., 2011).
PIK3CA/AKT1:
Everolimus targeting to MTOR, 肾小细胞肾癌 Temsirolimus targeting to MTOR, Approved for kidney cancer
大连大学附属中山医院分子病理与基因检测报告单
注:结果只针对该检测样本。请结合临床!
目前没有针对其他基因突变的特异性靶向药物。 VHL: Suggested targets for VHL-related cancers include targets of the HIF pathway, such as VEGF. Inhibitors of VEGF receptor sorafenib, sunitinib, pazopanib, and recently axitinib have been approved by the FDA.The mTOR inhibitor rapamycin analogs everolimus and temsirolimus or VEGF monoclonal antibody bevacizumab may also be an option. Trametinib 是MAP2K1, MAP2K2抑制剂, 针对NRAS 下游信息通路的靶向药物, FDA批准用于BRAF V600E or V600K 突变的黑色素瘤。 针对ERBB4抑制剂在肺癌中的二期临床药物进行之中:BMS-690514;一期临床JNJ26483327
医师科根据临床的实际情况,酌情下医嘱。
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